Если Вам требуется просто скопировать файлы, то поступайте следующим образом. Сделайте самораспаковывающийся архив, включив в него нужные файлы и каталоги. Для этого используйте любой архиватор (WinZip, WinRAR). В итоге у вас получится один exe-файл. Далее поступайте также, как и при создании обычного пакета.
При формировании списка пакетов MultiSet проверяет путь к исполняемому файлу. Если он его не находит, то напротив имени пакета будет иконка с красным диском.